Комиссия Российского футбольного союза по лицензированию приняла решение о выдаче лицензий на право участия в соревнованиях под эгидой РФС в сезоне-2006 всем 16 клубам премьер-лиги. В то же время, "Шинник" (Ярославль), "Зенит" (Санкт-Петербург) и "Сатурн" (Раменское) были предупреждены о необходимости выполнения обязательных требований. Если клубы не примут рекомендованных мер по устранению недостатков, к ним могут быть применены дисциплинарные санкции, вплоть до отзыва лицензии. Предупреждения в связи с различными нарушениями вынесены также "Спартаку" (Нальчик), ФК "Москва", "Крыльям Советов" (Самара) и "Амкару" (Пермь), замечания рекомендательного характера сделаны московскому "Локомотиву" и "Ростову".