Авиакомпания Estonian Air Regional получила право выполнения полетов на временной основе по маршруту Таллин - Санкт-Петербург - Таллин до конца летнего сезона 2009 года. Об этом представители Минтранса РФ сообщили на заседании совместной транспортной комиссии между Министерством транспорта Российской Федерации и Министерством экономики и коммуникаций Эстонской Республики. Как сообщает пресс-служба Минтранса, вопрос продления разрешения на выполнение полетов в зимнем сезоне будет решаться в рабочем порядке авиационными администрациями сторон. Также на заседании стороны договорились обменяться до 15 октября 2009 года дополнительно 3500 разрешениями на перевозки грузов в двустороннем и транзитном сообщении в целях обеспечения торгово-экономического сотрудничества между двумя странами в 2009 году. Достигнута договоренность о предварительном обмене на 2010 год 17000 разрешениями на двусторонние перевозки грузов и транзитный проезд.

Эстонская сторона проинформировала российскую сторону о транспортно - эксплуатационном состоянии автодорожного моста через реку Нарва, как объекта транспортной инфраструктуры АПП Ивангород - Нарва. Департаментом шоссейных дорог Эстонской Республики в установленном порядке 25 сентября 2009 г. объявлен конкурс на выполнение комплекса работ, включающего в себя разработку проектной документации на ремонт моста и непосредственно ремонт указанного моста. Российской стороне предложено рассмотреть возможность участия российских дорожных организаций в этом конкурсе.

Стороны также отметили необходимость ускорения работы по подготовке к подписанию Соглашения между правительством РФ и правительством Эстонской Республики о сотрудничестве в морском поиске и спасании людей, терпящих бедствие в Финском заливе, также о сотрудничестве в борьбе с загрязнением Балтийского моря нефтью и другими вредными веществами.