В Красноярске расшифровали геном лиственницы

Размер генома у хвойных превышает человеческий в 4-9 раз

Красноярск, 18 февраля 2019, 11:17 — REGNUM  Генетики Сибирского федерального университета провели секвенирование, сборку и аннотацию ядерного, митохондриального и хлоропластного геномов сибирской лиственницы, сообщает 18 февраля пресс-служба вуза.

Ядерные геномы хвойных имеют громадный размер, в 4−9 раз превыщающий геном человека и состоящий на 70−80% из высокоповторяющихся элементов. Это в значительной степени затрудняет их анализ, и в мире существуют только две команды учёных, сумевших расшифровать геном хвойного дерева.

«Нам удалось разработать и реализовать уникальную методику поэтапной сборки генома «по частям», которая позволяет обойти ограничения современных ассемблеров и получить надёжную сборку генома сибирской лиственницы, соответствующую исходному биологическому материалу, — сообщил заведующий кафедрой высокопроизводительных вычислений ИКИТ, кандидат технических наук Дмитрий Кузьмин. — Наша методика позволяет осуществлять относительно быструю сборку очень больших геномов на сравнительно небольших объёмах вычислительных ресурсов».

Другим важным результатом исследования стала расшифровка хлоропластного генома лиственницы сибирской, его сравнение с хлоропластными геномами других хвойных и обнаружение однонуклеотидных полиморфизмов. Ранее результаты этого исследования опубликованы в журнале BMC Bioinformatics.

Читайте ранее в этом сюжете: Российские учёные исследуют возможности лиственницы противостоять засухе

Если Вы заметите ошибку в тексте, выделите её и нажмите Ctrl + Enter, чтобы отослать информацию редактору.
×

Сброс пароля

E-mail *
Пароль *
Имя *
Фамилия
Регистрируясь, вы соглашаетесь с условиями
Положения о защите персональных данных
E-mail