Официально Марийский государственный университет был организован 1 января 1972 года. Первый учебный год у университете начался в 1972 году. Становление университета было сложным процессом, потребовавшим на первых порах напряжения всех сил немногочисленного научно-педагогического коллектива. Необходимо было привлечь молодежь перспективой обучения, сформировать коллектив высококвалифицированных педагогов, создать материальную базу. В становлении университета, особенно в начальной стадии, приняли участие многие учреждения, предприятия и организации Марийской АССР, ведущие вузы страны. 1 августа 1971 года первым ректором Марийского государственного университета приказом по Министерству высшего и среднего специального образования РСФСР был назначен доктор биологических наук, профессор, прибывший в г. Йошкар-Олу из Пермского государственного университета.

С декабря 1971 года начало работать подготовительное отделение с дневной формой обучения, куда были приняты 100 первых слушателей. А с 1 января 1972 года факультет естествознания Марийского государственного педагогического института в полном составе со всеми своими лабораториями становится биолого-химическим факультетом университета - первым факультетом МарГУ. В первый год существования в университете было 4 факультета (физико-математический, историко-филологический, сельскохозяйственный и биолого-химический), 4 межфакультетских и 10 специальных кафедры. В конце ноября в Йошкар-Оле в одном из концертных залов столицы Марий Эл состоится празднование дня рождения МарГУ.