Троицкой ГРЭС грозят крупные штрафы за многочисленные нарушения природоохранного законодательства. Троицкая ГРЭС, находящаяся в собственности РАО "ЕЭС России", нарушила водный кодекс, устанавливающий нормы водопользования. По словам специалистов, Троицкая ГРЭС не имеет нормативной документации и лицензии на водопользование с 1999 года. Кроме того, зафиксированы факты нарушения ГРЭС правил эксплуатации рыбозащитных сооружений - гидроэлектростанция осуществляет водозабор в период нереста рыбы, нанося ущерб рыбным ресурсам области. В настоящее время природоохранной прокуратурой рассматривается вопрос о наложении штрафных санкций на Троицкую ГРЭС. Размер штрафов может достигнуть нескольких сотен минимальных размеров оплат труда.