Результаты обобщённого анализа качества воды в Москва-реке за 2004 год, проведённого ГУП "Мосэкомониторинг", свидетельствуют о превышении культурно-бытовых нормативов железа, марганца, сульфидов, формальдегидов и ХПК, сообщили ИА REGNUM в пресс-службе департамента природопользования г. Москвы. Причём, река Москва загрязнена металлами и сульфидами уже на входе в город 1,1-1,5 ПДК для железа и марганца соответственно и 3,9 ПДК для сульфидов, при этом высокие концентрации металлов являются фоновыми. К выходу из города среднегодовое содержание данных показателей качества речной воды уменьшается за счёт увеличения расхода реки и становится в пределах культурно-бытовых нормативов. Содержание биогенных веществ в Москве-реке в черте города увеличивается в 2 раза; содержание нефтепродуктов в Москве-реке увеличивается до 1,2 ПДК (культурно-бытовые) на центральном участке реки от Бабьегородской плотины до створа "ниже впадения Яузы", а затем к выходу из города снижается до 0,3.

В 2005 г. по поступившим от ГУП "Мосводоканал" и ГУП "Мосводосток" данным контроля качества воды в р. Москве состояние реки не ухудшилось. Концентрация свинца в контрольных створах не превышает нормативов культурно-бытовых водоёмов, а рыбохозяйственные нормативы превышает на уровне 1,5-2 ПДК. Превышения нефтепродуктов (за исключением аварийных сбросов) наблюдались не во всех створах реки. Самые высокие концентрации 57 ПДК (рыбохозяйственные нормативы) наблюдались в центре города в устье реки Пресня и Студенец-Ваганьковский. В остальных створах концентрации не превышали 3-5 ПДК.

Следует отметить, что по сравнению с 2004 г. концентрации нефтепродуктов несколько снизились.