Новороссийский государственный музей-заповедник был создан распоряжением края и по праву должен был носить статус краевого учреждения, но реорганизация, разделившая все государственные музеи на федеральные и муниципальные, превратила его в муниципальное. Сейчас статус музея переводится в соответствие с законодательством.